Hello,
I have tried several way to use this module with my data that for me fit to your examples but I always obtain this same message error at the very first step:“Fail to map your compound list to the database please check input!”
I tried both with compound name and HMDB ID:
HMDB05358
HMDB05365
HMDB42067
HMDB42126
HMDB42155
HMDB42184
HMDB42210
HMDB42213
HMDB42241
HMDB42935
HMDB42993
HMDB43105
HMDB43832
HMDB43940
HMDB43941
HMDB44642
HMDB44669
HMDB44722
HMDB44748
HMDB45502
HMDB05373
HMDB05398
HMDB05460
HMDB05472
HMDB10461
HMDB42202
HMDB42230
HMDB42236
HMDB42265
HMDB42434
HMDB42463
HMDB42469
HMDB42497
HMDB42504
HMDB42555
HMDB42591
HMDB42614
HMDB42636
HMDB42678
HMDB42695
HMDB42765
HMDB42787
HMDB42816
HMDB43932
HMDB43964
HMDB43991
HMDB44147
HMDB44153
HMDB44174
HMDB44207
HMDB44214
HMDB44267
HMDB44288
HMDB44320
HMDB44342
HMDB44363
HMDB44402
HMDB44418
HMDB44444
HMDB44484
HMDB44504
HMDB44531
HMDB44660
HMDB44740
HMDB44771
HMDB44797
HMDB44920
HMDB44926
HMDB44947
HMDB44953
HMDB44978
HMDB44985
HMDB44998
HMDB44999
HMDB45087
HMDB45108
HMDB45139
HMDB45160
HMDB45161
HMDB45181
HMDB45207
HMDB45297
HMDB45317
HMDB45343
HMDB45369
HMDB45467
HMDB45473
HMDB45494
HMDB45544
HMDB45550
HMDB45575
HMDB45693
HMDB45699
HMDB45723
HMDB45730
HMDB45749
HMDB45756
HMDB45793
HMDB45878
HMDB45898
HMDB45899
HMDB45949
HMDB46080
HMDB46081
HMDB46126
HMDB46251
HMDB46270
HMDB46276
HMDB46325
HMDB46438
HMDB46444
HMDB46467
HMDB46474
HMDB46558
HMDB46659
HMDB46708
HMDB46834
HMDB47023
HMDB47183
HMDB47190
HMDB47390
HMDB47558
HMDB47844
HMDB47850
HMDB47871
HMDB47878
HMDB47990
HMDB48033
HMDB48054
HMDB48076
HMDB48121
HMDB48188
HMDB48505
HMDB48511
HMDB48531
HMDB48538
HMDB48623
HMDB48645
HMDB48664
HMDB48706
HMDB48748
HMDB48790
HMDB48854
HMDB48855
HMDB49138
HMDB49144
HMDB49163
HMDB49170
HMDB49251
HMDB49269
HMDB49290
HMDB49309
HMDB49344
HMDB49389
HMDB49429
HMDB49430
HMDB49470
HMDB49684
HMDB49690
HMDB49763
HMDB49769
HMDB49787
HMDB49794
HMDB49871
HMDB49888
HMDB49908
HMDB49926
HMDB49960
HMDB50041
HMDB50080
HMDB50283
HMDB50289
HMDB50339
HMDB50345
HMDB50362
HMDB50369
HMDB50442
HMDB50458
HMDB50475
HMDB50494
HMDB50622
HMDB50755
HMDB50856
HMDB50863
HMDB50870
HMDB51048
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HMDB51413
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HMDB51452
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HMDB52431
HMDB52443
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HMDB55231
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HMDB55555
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HMDB44523
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HMDB48155
HMDB48170
HMDB48177
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HMDB48281
HMDB48287
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HMDB48315
HMDB48330
HMDB48369
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HMDB53743
HMDB54017
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HMDB55199
HMDB55205
HMDB55358
HMDB55369
HMDB05389
HMDB05405
HMDB05439
HMDB05444
HMDB10447
HMDB10452
HMDB10457
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HMDB42234
HMDB42351
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HMDB42671
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HMDB44395
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HMDB44737
HMDB44762
HMDB44769
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HMDB44898
HMDB44923
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HMDB45100
HMDB45126
HMDB45132
HMDB45212
HMDB45289
HMDB45315
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HMDB45541
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HMDB48026
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HMDB48469
HMDB48488
HMDB48508
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HMDB49262
HMDB49282
HMDB49283
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HMDB44917
HMDB44918
HMDB44944
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HMDB45690
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HMDB42375
HMDB42404
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HMDB42517
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HMDB44200
HMDB44201
HMDB44227
HMDB44252
HMDB44307
HMDB44390
HMDB44416
HMDB44659
HMDB44739
HMDB44763
HMDB44788
HMDB44868
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HMDB44919
HMDB44971
HMDB44972
HMDB45024
HMDB45050
HMDB45127
HMDB45153
HMDB45465
HMDB45493
HMDB45542
HMDB45566
HMDB45668
HMDB45692
HMDB45716
HMDB45717
HMDB45742
HMDB45743
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HMDB46461
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HMDB46533
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HMDB47177
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HMDB48398
HMDB48463
HMDB48484
HMDB48524
HMDB48525
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HMDB48720
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HMDB49077
HMDB49118
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HMDB49157
HMDB49323
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HMDB05455
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HMDB42531
HMDB42554
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HMDB42635
HMDB42676
HMDB42694
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HMDB44658
HMDB44664
HMDB44686
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HMDB44924
HMDB44931
HMDB44951
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HMDB48186
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HMDB48642
HMDB48662
HMDB48698
HMDB48788
HMDB48789
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HMDB48853
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HMDB49061
HMDB49117
HMDB49123
HMDB49142
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HMDB49267
HMDB49288
HMDB49387
HMDB49388
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HMDB49749
HMDB49767
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HMDB50287
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HMDB50307
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HMDB52401
HMDB52428
HMDB52441
HMDB52635
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HMDB42377
HMDB42384
HMDB42429
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ou : TG(52:0)
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TG(52:4)
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TG(52:2)
TG(56:4)
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TG(54:4)
TG(50:1)
TG(52:1)
TG(54:3)
TG(52:3)
TG(48:4)
PS(36:2)
TG(50:1)
TG(52:5)
TG(50:4)
TG(52:5)
TG(50:4)
TG(50:0)
TG(54:2)
TG(50:1)
TG(54:5)
TG(54:5)
TG(50:4)
TG(48:1)
TG(54:1)
DG(30:1)
TG(54:1)
DG(38:5)
TG(56:4)
ST(20:5)
DG(30:0)
ST(18:0)
DG(33:1)
DG(40:6)
TG(52:7)
and for the microbiome I tried at genus level
Ralstonia
Phyllobacterium
Sphingobium
Herbaspirillum
Brevundimonas
Dechlorobacter
Lachnospiraceae_NK4A136_group
Thermoactinomyces
Chloroplast
Diaphorobacter
Kocuria
Gluconobacter
Cutibacterium
Bacteroides
Lachnospiraceae_UCG-010
Incertae_Sedis
Enterobacter
Novosphingobium
Corynebacterium
Listeria
Streptococcus
uncultured
uncultured
Erysipelothrix
Aliidiomarina
Magnetospira
Lactobacillus
Catenibacterium
Kineosporia
Jeotgalicoccus
Denitratisoma
Planifilum
Nitrospira
Sutterella
uncultured
CAG-56
Methanoculleus
uncultured
Gordonibacter
uncultured
Chryseobacterium
Could you help me please?
Geraldine